Краевой трахоматозный диспансер образован 04.01.1950 года на основании Постановления Совета Министров СССР № 5036 от 31.10.1949 года и Решения Ставропольского Крайисполкома № 11 от 04.01.1950 года «Об упорядочении сети и установлении единой номенклатуры учреждений здравоохранения».
В 1959г. в Краевом офтальмологическом диспансере открылся первый (на протяжении 60 лет был единственным в Ставропольском крае) краевой глаукомный кабинет, занимающийся диагностикой, лечением и диспансерным наблюдением пациентов с глаукомой.
1962 год — открыт кабинет охраны зрения детей.
1969 год — открыт кабинет глазного протезирования.
С момента основания у диспансера были следующие задачи:
- Оказание больным трахомой высококвалифицированной специализированной помощи.
- Выявление, учет, лечение больных трахомой.
- Профилактика трахомы в Ставропольском крае.
- Усовершенствование и специализация офтальмологических кадров городов и районов Ставропольского края.
На основании Приказа МЗ СССР № 66 от 30.01.1969 года «О полной и устойчивой ликвидации трахомы в СССР» изменены функции диспансера: оказание населению городов и районов Ставропольского края высококвалифицированной медицинской помощи при других заболеваниях органа зрения.
Документы диспансера за 1950-1979 гг. впервые подверглись научно-технической обработке, но некоторые из них были утеряны, в связи с тем, что Краевой трахоматозный диспансер не был включен в список краевых учреждений.
Приказом Управления Здравоохранения Ставропольского края № 05-02/704 от 06.12.1990 года «О структурных подразделениях краевого трахоматозного диспансера» утверждены структурные подразделения и штаты диспансера, разработаны Положение, Устав диспансера, положения о всех структурных подразделениях. Деятельность диспансера регламентировалась Положением и Уставом краевого трахоматозного диспансера, а также статьями №№ 5, 6, 7, 8, 10, 11, 15, 16, 19, 20, 21, 22 Закона СССР «О государственном предприятии», основами законодательства Союза ССР и Союзных республик по здравоохранению и быту.
В 1996 году Постановлением главы администрации Ставропольского края № 638 от 27.09.1996 года и Приказом КУЗ СК № 05-02/345 от 10.10.1996 года, Приказом ККБ № 162 от 14.10.1996 года в целях более эффективного использования материальных, трудовых и финансовых ресурсов Краевой трахоматозный диспансер стал структурным подразделением Краевой клинической больницы.
Приказом МЗ РФ № 190 от 04.06.2001 года и письмом МЗ СК № 05-02/190 от 02.08.2001 года Краевой трахоматозный диспансер переименован в Краевой офтальмологический диспансер.
Приказом МЗ СК от 17.12.2001 года № 05-02/284 «О совершенствовании офтальмологической службы ККБ» с 01.01.2002 года на базе Краевого офтальмологического диспансера открыт дневной стационар на 5 коек в две смены.