На протяжении всего времени существования краевой больницы в ее структуру входила аптека.

В начале XX века в предложениях комиссии по устройству новой больницы указывалось: «При больнице иметь амбулаторную лечебницу, гинекологическое отделение, заразный барак. И чтобы лекарства в амбулаторной лечебнице выдавались бесплатно».

В проекте архитектора Смыслова и инженера Булыгина предусматривалась среди прочих и аптека, располагавшаяся в строении барачного типа (перекрёсток улиц Батальонной и Параллельной, ныне – улицы Лермонтова и Ломоносова).

Аптека была организована как производственная. Во все годы   большой объем в работе аптеки занимал процесс изготовления инъекционных растворов, растворов для физиотерапии, для наружного применения, дезинфицирующих растворов.

С 1965 года аптечная служба    располагалась на двух территориях:

– главный корпус по ул. Семашко, 1;

– филиал по ул. Лермонтова, 208 (отделения развернуты по павильонному типу).

С 1973 года аптекой заведовала В.В. Зайцева (главный корпус), на филиале –  Л.Л. Старовойтова.

Более 30 лет заведующей аптекой являлась Применко Евгения Георгиевна.

В период с 2010 по 2012 годы этим подразделением руководила    Омельченко А.А.

С 2013 года возглавляет аптеку Людмила Викторовна Черкашина.

С 1983 года по 1993 год аптека была в структуре Ставропольского аптечного управления под номером 278.

А с 1 марта 1993 года аптека № 278 была включена  в структуру краевой клинической больницы и стала одним из её подразделений, что помогло значительно улучшить медикаментозное обеспечение пациентов Краевой клинической больницы лекарственными средствами и предметами медицинского назначения, экономичнее использовать средства, выделяемые на лекарственное обеспечение.

С 1 июля 2020 года в связи со вступлением в силу Федерального закона от 27.12.2019 № 462-ФЗ «О внесении изменений в Федеральный закон «Об обращении лекарственных средств» и Федеральный закон «О внесении изменений в Федеральный закон «Об обращении лекарственных средств»» введена маркировка лекарственных препаратов средством идентификации (код DataMatrix). Основная цель маркировки лекарственных препаратов – защита населения от попадания в обращение фальсифицированных, недоброкачественных и контрафактных лекарственных препаратов.

Основным условием успешной работы нашей   аптеки является  рациональная  организация  труда  её  работников  и  личная  ответственность  каждого за  результаты.

Здесь  работает дружный, сплоченный коллектив. Стаж работы каждого составляет более 20 лет.  Все провизоры и фармацевты аптеки больницы имеют высшую квалификационную категорию.

Аптека ГБУЗ СК СККБ обеспечивает лекарственными средствами собственного изготовления, готовыми лекарственными средствами и изделиями медицинского назначения все стационарные отделения и параклинические службы больницы; является эффективным звеном ГБУЗ СК «Ставропольская краевая клиническая больница», способствует организации качественного лекарственного обеспечения, безопасности лекарственной терапии и оптимизации расходования лекарственных средств.